التحليل المكاني المتعدد - أوميكس لسرطان الكلى ذو الخلايا الصافية قبل العلاج المناعي وبعده

الملخص المقدمة: غيرت العلاجات المناعية (IO) ومثبطات كيناز بيروزن الخلايا التي تستهدف VEGF نتائج المرضى المصابين بسرطان الكلى ذو الخلايا الصافية المتقدم (ccRCC). ومع ذلك، يظل فهم آليات مقاومة العلاج بعد العلاج المناعي أقل بكثير. الطرق: شملت الدراسة 15 مريضًا (pts) يعانون من سرطان الكلى ذو الخلايا الصافية المتقدم ولديهم عينات ورمية قبل وبعد العلاج (Tx, IO-IO أو IO-TKI). تمت دراسة الأورام باستخدام منصة النانوسترينغ GeoMx للتحليل المكاني. تم اختيار 4 إلى 12 منطقة اهتمام (ROIs) لكل مريض، وتم تقسيم هذه المناطق إلى مقصورات الورم (PanCK+)، المناعية (CD45+)، والنسيج الداعم (PanCK-، CD45-). تم تقييم الجينات والبروتينات المعبر عنها تفاضليًا باستخدام تحليل إغناء مجموعة الجينات (GSEA). تم تفكيك التعبير الجيني الإجمالي أكثر لتوصيف مجموعات الخلايا المناعية باستخدام CIBERSORT. قامت خوارزميات التعلم العميق بتحليل توقيعات الجينات. النتائج: زادت أهداف العلاج القابلة للدواء مثل Axl وHER2 بشكل كبير في الأورام بعد العلاج المناعي (p<0.01) لكن ليس بعد IO-TKI (Log2FC -0.070، p>0.01). بعض المرضى الذين تلقوا IO/TKIs شهدوا انخفاضًا في تعبير الأوعية الدموية الورمية بعد العلاج. صنف التجميع NMF المرضى بعد العلاج في NMF4 في 6 من 15 مريضًا (4 من 10 في مجموعة IO-TKI و2 من 5 في مجموعة IO-IO). استمر وجود مجموعة NMF 3 بعد العلاج المناعي في معظم المرضى. في حين أن معظم العينات قبل العلاج المناعي أظهرت تسللًا مناعيًا متوسطًا إلى عاليًا، كانت العينات بعد العلاج المناعي أعلى مستوياتًا. بشكل ملحوظ، كشف ملف CIBERSORT أن نسبة الخلايا التائية المنظمة المثبطة للمناعة انخفضت بعد العلاج المناعي (IO-TKI، p<0.01)، في حين زادت خلايا CD8+ السامة (IO-TKI، p<0.01) مع كلا المجموعتين العلاجيتين. ومع ذلك، زادت خلايا NK الساكنة (p=0.29)، في حين انخفضت خلايا NK النشطة (p<0.01) بشكل كبير فقط في مجموعات IO-IO المعالجة. الخلاصة: كشفت التغيرات الجزيئية في التعبير الجيني في سرطان الكلى بعد العلاج المناعي عن أهداف علاجية في الأورام المتبقية. يشير استمرار مجموعة NMF 4، وتسلل خلايا CD8+، وانخفاض نسبة Treg إلى توسع أو بقاء الخلايا المناعية بعد العلاج المناعي. قد يفسر وجود مجموعة NMF 3 والنسبة المتزايدة من خلايا NK الساكنة مقاومة الأورام المتبقية بعد العلاج المناعي. نظرًا لتفاوت سرطان الكلى، من الضروري توصيف الأورام الفردية لتحسين نتائج العلاج المناعي. تشمل التحليلات الجارية التحقق من الأهداف باستخدام IHC.