التحليل متعدد الأوميكس الفراغي ثلاثي الأبعاد لأورام المعدة يكشف عن ميزات مخفية

Key Points

• الهدف هو استكشاف حدود التحليلات ثنائية الأبعاد في التقاط الهيكل المعقد لأورام المعدة باستخدام تحليل متعدد الأوميكس فضائي ثلاثي الأبعاد.
• استخدم منصة G4X لقراءات RNA والبروتين in-situ
• حلل مقاطع FFPE متسلسلة لقياس كميات RNA والبروتينات المستهدفة
• سجل المقاطع داخل إطار ثلاثي الأبعاد موحد لإعادة بناء أطلس حجمي
• حصل على تصوير هولوتوموغرافي ثلاثي الأبعاد بدون علامات للتمثيل الهيكلي
• طبق تقسيم الخلايا الفردية بواسطة الذكاء الاصطناعي لرسم خرائط دقيقة لأنواع الخلايا.
• حدد تباينًا قويًا في تراكيب أنواع الخلايا في الشرائح ثنائية الأبعاد
• كشف عن نطاق متماسك من خلايا T المتعبة فقط في التحليلات ثلاثية الأبعاد
• أكد استمرارية بين خلايا T والمصفوفة خارج الخلية وخلايا الورم باستخدام الهولوتوموغرافي
• أبرز احتمال فقدان مواقع مناعية ذات صلة سريريًا في تحليلات المقطع الواحد
• عرض سير عمل عملي لتحليل الأورام والحالة المناعية حجميًا.

Abstract