Key points are not available for this paper at this time.
نقدم نتائج تحسين مجال القوة OPLS-AA للببتيدات عن طريق إعادة ضبط معاملات الفورير الالتوائية الرئيسية. تجمع تقنية الضبط بين استخدام بيانات أب إنيشيو الدقيقة كهدف، واختيار فضاء فرعي فعال للضبط من كامل سطح طاقة الوضع، وتحديد أوزان لكل نقطة ضبط بناءً على مقدار تدرج طاقة الوضع. تم تقليل متوسط الانحراف الجذري لمربعات الطاقة من بيانات LMP2/cc-pVTZ(-f)//HF/6-31G** حوالي 40% من 0.81 إلى 0.47 كيلو كالوري/مول كنتيجة للضبط للببتيدات الثنائية غير المشحونة كهربائياً. تم إثبات قابلية نقل المعلمات باستخدام نفس معاملات الالتواء الخلفية الملائمة للببتيد الثنائي لألانين لجميع الببتيدات الثنائية الأخرى (مع إعادة ضبط مناسبة للسلسلة الجانبية) والببتيد الرباعي لألانين. كما تمت إعادة ضبط معاملات التفاعلات غير الترابطية للببتيدات الثنائية المحتوية على الكبريت (السيستئين والميثيونين)، وتم إثبات صلاحية الشحنات الكهربائية الجديدة ومعاملات فان دير فالس σ و ε من خلال إعادة إنتاج طاقات الطور الغازي لتشكيل المعقدات، وحرارة التبخر، وكثافات السوائل النموذجية النقية. علاوة على ذلك، قدمنا نهجًا جديدًا لضبط معاملات الالتواء للأنظمة الجزيئية المشحونة كهربائيًا وتم اختباره بنجاح على خمسة ببتيدات ثنائية ذات سلاسل جانبية مشحونة.
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
George A. Kaminski
Richard A. Friesner
Julian Tirado‐Rives
The Journal of Physical Chemistry B
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
درس كامنسكي وآخرون (Thu,) هذا السؤال.
www.synapsesocial.com/papers/69d75a12df21310ab048f6bf — DOI: https://doi.org/10.1021/jp003919d
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: