Key points are not available for this paper at this time.
عدد الجينومات الكاملة والمسودات آخذ في الازدياد السريع في السنوات الأخيرة، وأصبح من المهم بشكل متزايد أتمتة تحديد الخصائص الوظيفية والأدوار البيولوجية للجينات في هذه الجينومات. في قاعدة بيانات KEGG، يتم ترميز الجينات في الجينومات الكاملة بمعرّفات KEGG orthology (KO)، أو أرقام K، استنادًا إلى أفضل ضربة باستخدام درجات Smith-Waterman وكذلك عن طريق التدقيق اليدوي. يمثل كل رقم K مجموعة متجانسة من الجينات، وهو مرتبط مباشرةً بكائن في خريطة مسار KEGG أو تسلسل BRITE الوظيفي. هنا، قمنا بتطوير خادم ويب يُسمى KAAS (خادم الترميز التلقائي لـ KEGG: http://www.genome.jp/kegg/kaas/) وهو تنفيذ لطريقة سريعة لتعيين أرقام K تلقائيًا للجينات في الجينوم، مما يمكّن من إعادة بناء مسارات KEGG وتسلسلات BRITE. تستند الطريقة إلى تشابهات التسلسل، ومعلومات أفضل ضربة ثنائية الاتجاه وبعض قواعد الخبرة، وقد حققت درجة عالية من الدقة مقارنةً بقاعدة بيانات KEGG GENES المدققة يدويًا.
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
Yuki Moriya
Masumi Itoh
Shujiro Okuda
Nucleic Acids Research
Kyoto University
Kyoto University Institute for Chemical Research
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
درس موريا وآخرون (الثلاثاء،) هذا السؤال.
www.synapsesocial.com/papers/69d775c7f44a16d01ef312e4 — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkm321
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: