مقارنة أساليب التمييز لتصنيف الأورام باستخدام بيانات التعبير الجيني

يُعد التصنيف الدقيق والموثوق للأورام أمرًا ضروريًا للتشخيص الناجح وعلاج السرطان. تُعد الشرائح الدقيقة للحمض النووي التكميلي ورقائق الأوليجنوكليوتيدات عالية الكثافة تقنيات حيوية جديدة تُستخدم بشكل متزايد في أبحاث السرطان. من خلال السماح بمراقبة مستويات التعبير في الخلايا لآلاف الجينات في وقت واحد، قد تؤدي تجارب الشرائح الدقيقة إلى فهم أكثر شمولاً للتغيرات الجزيئية بين الأورام ومن ثم إلى تصنيف أدق وأكثر إفادة. القدرة على التمييز بنجاح بين فئات الأورام (المعروفة بالفعل أو التي لم تُكتشف بعد) باستخدام بيانات التعبير الجيني هي جانب مهم من هذا النهج الجديد لتصنيف السرطان. تقارن هذه المقالة أداء أساليب التمييز المختلفة لتصنيف الأورام بناءً على بيانات التعبير الجيني. تشمل الطرق مصنّفات الجار الأقرب، التحليل التمييزي الخطي، وأشجار التصنيف. كما تُؤخذ بعين الاعتبار طرق تعلم الآلة الحديثة مثل التجميع والتعزيز. تُطبق طرق التمييز على مجموعات بيانات من ثلاث دراسات حديثة منشورة حول التعبير الجيني للسرطان.