استخدام تحليل التعبير الجيني لتحديد الفئات التنبؤية في سرطان الدم النخاعي الحاد لدى البالغين

الخلفية: في المرضى المصابين بسرطان الدم النخاعي الحاد (AML)، تُستخدم وجود أو غياب التشوهات الصبغية المتكررة لتحديد العلاج المناسب. ومع ذلك، فإن نظام التصنيف الحالي لا يعكس بشكل كامل التغاير الجزيئي للمرض، ويصعب تصنيف العلاج، خاصةً للمرضى الذين يعانون من AML متوسط الخطورة مع كروموسومات طبيعية. الطرق: استخدمنا شرائح الحمض النووي التكاملي لتحديد مستويات التعبير الجيني في عينات الدم المحيطي أو عينات نخاع العظام من 116 بالغًا مصابًا بـ AML (بما في ذلك 45 لديهم كروموسومات طبيعية). استخدمنا تحليل التجميع الهرمي غير الخاضع للإشراف لتحديد مجموعات جزيئية ذات توقيعات تعبير جيني مميزة. باستخدام مجموعة تدريب من عينات 59 مريضًا، طبقنا خوارزمية تعلم إشرافي جديدة لتصميم مؤشر تنبؤ سريري مبني على التعبير الجيني، والذي اختبرناه بعد ذلك باستخدام مجموعة تحقق مستقلة مكونة من 57 مريضًا متبقين. النتائج: كشف التحليل غير الخاضع للإشراف عن أنواع جزيئية جديدة من AML، بما في ذلك مجموعتين ذات أهمية تنبؤية في AML مع كروموسومات طبيعية. باستخدام خوارزمية التعلم الإشرافي، أنشأنا مؤشر تنبؤ سريري مثالي يتألف من 133 جينًا، الذي تنبأ بدقة بالبقاء الكلي بين المرضى في مجموعة التحقق المستقلة (P=0.006)، بما في ذلك المجموعة الفرعية من مرضى AML ذوي الكروموسومات الطبيعية (P=0.046). في التحليل المتعدد المتغيرات، كان مؤشر التعبير الجيني عامل تنبؤي مستقل قوي (نسبة الأرجحية 8.8؛ فترة الثقة 95٪، من 2.6 إلى 29.3؛ P<0.001). الاستنتاجات: يحسن استخدام ملف التعبير الجيني التصنيف الجزيئي لسرطان الدم النخاعي الحاد لدى البالغين.