Key points are not available for this paper at this time.
هناك العديد من مصادر التغير المنهجي في تجارب المصفوفة الدقيقة لـ cDNA التي تؤثر على مستويات التعبير الجيني المقاسة (مثل الاختلافات في كفاءة الوسم بين الصبغين الفلوريين). يشير مصطلح التطبيع إلى عملية إزالة هذا التغير. غالبًا ما يُستخدم تعديل ثابت لإجبار توزيع نسب اللوغاريتمات للشدة على الحصول على وسط قيم يساوي صفر لكل شريحة. ومع ذلك، فإن طرق التطبيع الشامل هذه ليست كافية في الحالات التي قد تعتمد فيها تحيزات الصبغة على شدة البقعة الكلية و/أو الموقع المكاني داخل المصفوفة. تقترح هذه المقالة طرق تطبيع تعتمد على الانحدار المحلي المتين وتأخذ في الاعتبار الاعتماد على الشدة والموقع المكاني في تحيزات الصبغة لأنواع مختلفة من تجارب المصفوفة الدقيقة لـ cDNA. كما يُناقش اختيار الضوابط المناسبة للتطبيع ويتم تقديم مجموعة جديدة من الضوابط (تجمع عينات المصفوفة الدقيقة، MSP) للمساعدة في التطبيع المعتمد على الشدة. وأخيرًا، للسماح بمقارنات مستويات التعبير عبر الشرائح، يُقترح طريقة متينة تعتمد على تقدير الاحتمالية القصوى لتعديل فروق المقياس بين الشرائح.
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
Jean Yang
Nucleic Acids Research
University of California, Berkeley
Building similarity graph...
Analyzing shared references across papers
Loading...
درس جان يانغ (الجمعة) هذا السؤال.
www.synapsesocial.com/papers/6a08dd8d27ceb0c2a2d60b03 — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/30.4.e15
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: