Identifizierung neuer chemoresistenzassoziierter Gene beim triple-negativen Mammakarzinom durch Einzelzell-Transkriptomanalyse

Das triple-negative Mammakarzinom (TNBC) ist eine besonders aggressive Brustdrüsentumorerkrankung mit hoher Sterblichkeitsrate, hauptsächlich aufgrund der Entwicklung von Resistenz gegen die verabreichte Chemotherapie, die Standardbehandlung dieser Erkrankung. In dieser Studie verwenden wir sowohl Bulk-RNA-Sequenzierung als auch Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scRNA-seq), um die transkriptionelle Landschaft von TNBC-Zellen zu untersuchen, die in zweidimensionalen Monolagen oder dreidimensionalen Sphäroiden kultiviert werden, vor und nach der Entwicklung einer Resistenz gegenüber den chemotherapeutischen Wirkstoffen Paclitaxel und Doxorubicin. Unsere Ergebnisse zeigen eine signifikante transkriptionelle Heterogenität innerhalb der TNBC-Zellpopulationen, wobei die scRNA-seq seltene Zelluntergruppen identifiziert, die resistenzassoziierte Gene exprimieren, welche durch die Bulk-RNA-Sequenzierung nicht detektiert wurden. Darüber hinaus beobachten wir eine partielle Verschiebung hin zu einem stark mesenchymalen Phänotyp in chemoresistenten Zellen, was darauf hindeutet, dass der epithelial-mesenchymale Übergang (EMT) ein verbreiteter Resistenzmechanismus in Untergruppen dieser Zellen ist. Diese Erkenntnisse heben potenzielle therapeutische Ziele hervor, wie den PDGF-Signalweg, der EMT vermittelt und in diesem Kontext genutzt werden könnte. Unsere Studie unterstreicht die Bedeutung von Einzelzellansätzen zum Verständnis der Tumorheterogenität und zur Entwicklung effektiverer, personalisierter Behandlungsstrategien zur Überwindung der Chemoresistenz bei TNBC.