NCBI GEO: Archiv für funktionelle Genomik-Datensätze – Aktualisierung

Das Gene Expression Omnibus (GEO, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) ist ein internationales öffentliches Archiv für Hochdurchsatz-Microarray- und Next-Generation-Sequenz-Funktionalgenomik-Datensätze, die von der Forschungsgemeinschaft eingereicht werden. Die Ressource unterstützt die Archivierung von Rohdaten, verarbeiteten Daten und Metadaten, die indiziert, verlinkt und durchsuchbar sind. Alle Daten sind in verschiedenen Formaten frei zum Download verfügbar. GEO bietet außerdem mehrere webbasierte Werkzeuge und Strategien, um Benutzer bei der Abfrage, Analyse und Visualisierung der Daten zu unterstützen. Dieser Artikel berichtet über den aktuellen Status und jüngste Entwicklungen der Datenbank, einschließlich der Veröffentlichung von GEO2R, einer auf R basierenden Webanwendung, die Nutzern bei der Analyse von GEO-Daten hilft.