Das Unified Medical Language System (UMLS): Integration biomedizinischer Terminologie

Das Unified Medical Language System (http://umlsks.nlm.nih.gov) ist ein Repositorium biomedizinischer Vokabulare, entwickelt von der US National Library of Medicine. Das UMLS integriert über 2 Millionen Namen für etwa 900.000 Konzepte aus mehr als 60 Familien biomedizinischer Vokabulare sowie 12 Millionen Beziehungen zwischen diesen Konzepten. Zu den im UMLS Metathesaurus integrierten Vokabularen gehören die NCBI-Taxonomie, Gene Ontology, Medical Subject Headings (MeSH), OMIM und die Digital Anatomist Symbolic Knowledge Base. UMLS-Konzepte sind nicht nur untereinander verknüpft, sondern können auch mit externen Ressourcen wie GenBank verbunden sein. Neben den Daten umfasst das UMLS Werkzeuge zur Anpassung des Metathesaurus (MetamorphoSys), zur Generierung lexikalischer Varianten von Konzeptnamen (lvg) und zur Extraktion von UMLS-Konzepten aus Texten (MetaMap). Die UMLS-Wissensquellen werden vierteljährlich aktualisiert. Alle Vokabulare sind für Forschungszwecke innerhalb einer Institution gebührenfrei verfügbar, jedoch müssen UMLS-Nutzer eine Lizenzvereinbarung unterzeichnen. Die UMLS-Wissensquellen werden auf CD-ROM und per FTP verteilt.