3D-räumliche Profilierung des prägastrischen Krebsfortschreitens mittels gleichzeitiger RNA-Protein-Analyse auf demselben Objektträger

Key Points

• Ziel ist es, räumliche Merkmale zu identifizieren, die fortschreitende von nicht fortschreitenden präkanzerösen Nischen im Magengewebe unterscheiden.
• Profilierung von FFPE-Magengewebe mittels einer multimodalen Plattform, die RNA- und Proteinanalysen kombiniert.
• Verwendung fluoreszierender H&E-Färbung und 3D-Holotomographie zur Visualisierung räumlicher Beziehungen.
• Anwendung von Clustering und Klassifizierung transkriptomischer und morphologischer Merkmale zur Definition von Zellzuständen.
• Auflösung verschiedener epithelialer, stromaler und immunologischer Kompartimente im präkanzerösen Gewebe.
• Beobachtung einer Expansion epithelialer und immunologischer Zustände in krebsartigen Regionen mit veränderten Kompartimentgrenzen.
• Kartierung der Verteilung von Immunzellen in Bezug auf das Magenephitel und Verfeinerung der Läsionsgrenzen in 3D.

Abstract