Phaser-Kristallographiesoftware

Phaser ist ein Programm zur Phasenermittlung makromolekularer Kristallstrukturen sowohl durch Molekulare Ersatzmethode als auch durch experimentelle Phasierungsmethoden. Die neuartigen in Phaser implementierten Phasierungsalgorithmen wurden unter Verwendung von Maximum-Likelihood und Multivariaten Statistiken entwickelt. Für die molekulare Ersatzmethode haben sich die neuen Algorithmen als deutlich besser erwiesen als traditionelle Methoden, um korrekte Lösungen von Rauschen zu unterscheiden, und für die experimentelle Phasierung mittels Einwellenlängen-anomaler Dispersion liefern die neuen Algorithmen, die Korrelationen zwischen F(+) und F(-) berücksichtigen, bessere Phasen (geringerer mittlerer Phasenfehler im Vergleich zu den Phasen der verfeinerten Struktur) als solche, die den Mittelwert von F und die anomalien Differenzen DeltaF verwenden. Eines der Designkonzepte von Phaser war eine hohe Automatisierung zu ermöglichen. Zu diesem Zweck kann Phaser (in C++ geschrieben) direkt aus Python aufgerufen werden, obwohl es auch mit dem traditionellen CCP4-Schlüsselwortstil eingaben genutzt werden kann. Phaser ist eine Plattform für die zukünftige Entwicklung verbesserter Phasierungsmethoden und deren Veröffentlichung, einschließlich Quellcode, für die kristallographische Gemeinschaft.