CRISPOR: intuitive Leitfadenauswahl für CRISPR/Cas9 Genomeditierungsexperimente und -screenings

CRISPOR.org ist ein Web-Tool für Genomeditierungsexperimente mit dem CRISPR-Cas9 System. Es findet Guide-RNAs in einer eingegebenen Sequenz und bewertet sie anhand verschiedener Scores, die potenzielle Off-Target-Stellen im Genom von Interesse evaluieren und die On-Target-Aktivität vorhersagen. Die Liste der Genome wird kontinuierlich erweitert, in den letzten zwei Jahren wurden über 150 Genome hinzugefügt. CRISPOR versucht eine umfassende Lösung zu bieten – von der Auswahl, Klonierung und Expression der Guide-RNA bis hin zur Bereitstellung der Primer, die zur Überprüfung der Guide-Aktivität und potenzieller Off-Target-Stellen benötigt werden. Neuere Entwicklungen umfassen Batch-Design für genomweite CRISPR- und Saturationsscreenings, das Erstellen kundenspezifischer Oligonukleotide für die Guide-Klonierung sowie das Design von Next-Generation-Sequencing-Primer, um Off-Target-Mutationen zu testen. CRISPOR ist verfügbar unter http://crispor.org, einschließlich des vollständigen Quellcodes der Webseite und einer eigenständigen Kommandozeilenversion.