Tiefgehende Analyse der Milzarchitektur der Maus mit CODEX multiplexer Bildgebung

Ein hoch multiplexiertes zytometrisches Bildgebungsverfahren, genannt Co-Detection by Indexing (CODEX), wird hier verwendet, um multiplexe Datensätze von normalen und lupus- (MRL/lpr) Mausmilzen zu erstellen. CODEX visualisiert iterative Antikörperbindungsevents mithilfe von DNA-Barcodes, fluoreszenten dNTP-Analoga und einem in situ polymerisationsbasierten Indexierungsverfahren. Eine algorithmische Pipeline zur Quantifizierung einzelner Zellantigene in dicht gepacktem Gewebe wurde entwickelt und genutzt, um bekannte morphologische Merkmale mit der de-novo-Charakterisierung der lymphoiden Gewebe-Architektur auf Einzelzell- und zellulärer Nachbarschaftsebene zu überlagern. Wir beobachteten einen unerwarteten, tiefgreifenden Einfluss der zellulären Nachbarschaft auf die Expression von Proteinkomplexrezeptoren auf Immunzellen. Im Vergleich von normaler Mausmilz zu Milzen von Tieren mit systemischer Autoimmunerkrankung (MRL/lpr) wurden umfangreiche und bisher uncharakterisierte dynamische Zell-Interaktionen im gesunden versus erkrankten Zustand festgestellt. Die hier demonstrierte hohe Treue der multiplexen räumlichen Zytometrie erlaubt eine quantitative systemische Charakterisierung der Gewebearchitektur in normalen und klinisch aberranten Proben.