Expressionsmuster von Genen bei Brustkarzinomen unterscheiden Tumorsubklassen mit klinischen Implikationen

Ziel dieser Studie war die Klassifizierung von Brustkarzinomen basierend auf Variationen in Expressionsmustern von Genen, die mittels cDNA-Microarrays ermittelt wurden, und die Korrelation der Tumoreigenschaften mit dem klinischen Verlauf. Insgesamt wurden 85 cDNA-Microarray-Experimente analysiert, die 78 Karzinome, drei Fibroadenome und vier normale Brustgewebeproben repräsentieren, mittels hierarchischem Clustering. Wie bereits zuvor berichtet, konnten die Karzinome in eine basal-epitheliale Gruppe, eine ERBB2-überexprimierende Gruppe sowie eine normal-brustähnliche Gruppe basierend auf Genexpressionsvariationen klassifiziert werden. Eine neuartige Erkenntnis war, dass die zuvor charakterisierte luminale epithelial/östrogenrezeptorpositive Gruppe mindestens in zwei Subgruppen unterteilt werden konnte, jede mit einem distinktiven Expressionsprofil. Diese Subtypen erwiesen sich als relativ robust durch Clusteranalysen mit zwei unterschiedlichen Gen-Sets: Erstens einem Satz von 456 cDNA-Klonen, die zuvor zur Abbildung intrinsischer Tumoreigenschaften ausgewählt wurden, und zweitens einem Genesatz, der stark mit dem Patientenoutcome korrelierte. Überlebensanalysen in einer Untergruppe von Patienten mit lokal fortgeschrittenem Brustkrebs, die einheitlich in einer prospektiven Studie behandelt wurden, zeigten signifikant unterschiedliche Ergebnisse für die Patienten der verschiedenen Gruppen, einschließlich einer schlechten Prognose für den basal-ähnlichen Subtyp und einem signifikanten Unterschied im Outcome für die beiden östrogenrezeptorpositiven Gruppen.