Rfam: Annotation nicht-kodierender RNAs in vollständigen Genomen

Rfam ist eine umfassende Sammlung von Familien nicht-kodierender RNA (ncRNA), dargestellt durch multiple Sequenzalignments und profilbasierte stochastische kontextfreie Grammatiken. Rfam zielt darauf ab, die Identifikation und Klassifikation neuer Mitglieder bekannter Sequenzfamilien zu erleichtern und verteilt Annotationen von ncRNAs in über 200 vollständigen Genomsequenzen. Die Daten liefern erste Einblicke in die Konservierung mehrerer ncRNA-Familien über ein breites taxonomisches Spektrum. Eine kleine Anzahl großer Familien ist in allen drei Lebensreichen essenziell, während viele kleinere Familien taxonspezifisch sind. Aktuelle Verbesserungen der Datenbank werden diskutiert, ebenso wie Herausforderungen für die Zukunft. Rfam ist im Web verfügbar unter http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam/ und http://rfam.wustl.edu/.