Genomische Landschaft der zellfreien DNA bei Patienten mit kolorektalem Krebs

„Liquid Biopsy“-Ansätze, die zellfreie DNA (cfDNA) aus dem Blut von Krebspatienten analysieren, werden zunehmend in der klinischen Praxis eingesetzt. Es ist jedoch noch nicht bekannt, ob das cfDNA-Sequenzieren aus großen Kohorten von Krebspatienten genomische Veränderungen in ähnlicher Häufigkeit wie die direkte Tumorsequenzierung detektieren kann und ob dieser Ansatz neue Erkenntnisse liefern kann. Hier berichten wir über Next-Generation-Sequenzierungsdaten von cfDNA von 1.397 Patienten mit kolorektalem Krebs. Insgesamt waren die Häufigkeiten genomischer Veränderungen, die in cfDNA nachgewiesen wurden, vergleichbar mit denen, die in drei unabhängigen, gewebebasierten Sequenzierungskompendien des kolorektalen Krebses beobachtet wurden. Unsere Analyse identifizierte außerdem einen neuartigen Cluster von Mutationen in der extrazellulären Domäne (ECD) von EGFR, die Resistenz vermitteln, indem sie die Bindung von Anti-EGFR-Antikörpern blockieren. Patienten mit EGFR-ECD-Mutationen zeigten eine ausgeprägte Tumorheterogenität, wobei 91 % mehrere unterschiedliche Resistenzveränderungen (Bereich 1-13; Median 4) aufwiesen. Diese Ergebnisse legen nahe, dass die cfDNA-Analyse die genomische Landschaft von Krebs effektiv definieren und wichtige biologische Einblicke liefern kann. Bedeutung: Diese Studie liefert eines der ersten Beispiele dafür, wie die groß angelegte genomische Profilierung von cfDNA von Patienten mit kolorektalem Krebs genomische Veränderungen in vergleichbarer Häufigkeit wie durch direkte Tumorsequenzierung erfassen kann. Die Sequenzierung von cfDNA ermöglichte zudem Einblicke in Tumorheterogenität und therapeutische Resistenz und identifizierte neuartige EGFR-Ektodomänen-Mutationen. Cancer Discov; 8(2); 164-73. ©2017 AACR. Dieser Artikel wird in der Rubrik „In This Issue“ auf Seite 127 hervorgehoben.