Verwendung von Oligonukleotid-Sondenarrays zur Erfassung genetischer Vielfalt

Während das Human Genome Project und verwandte Projekte die DNA-Sequenzen menschlicher Gene identifizieren und bestimmen, ist es wichtig, hochzuverlässige und effiziente Mechanismen zu finden, um individuelle genetische Variationen zugänglich zu machen. Nur durch ein besseres Verständnis der genetischen Vielfalt wird der wahre Nutzen des Human Genome Project realisiert werden. Ein Ansatz, die Hybridisierung mit hochdichten Arrays von Oligonukleotiden, ist ein schneller und effektiver Weg, auf diese genetische Variation zuzugreifen. Die lichtgesteuerte chemische Synthese wurde verwendet, um miniaturisierte, hochdichte Arrays von Oligonukleotidsonden zu erzeugen. Anwendungsbezogene Designs von Oligonukleotid-Sondenarrays wurden für das schnelle Screening charakterisierter Gene entwickelt. Spezielle Instrumente und Software wurden für Array-Hybridisierung, Fluoreszenzdetektion sowie Datengewinnung und -analyse entwickelt. In einer spezifischen und herausfordernden Anwendung wurden Oligonukleotid-Sondenarrays verwendet, um die Reverse-Transkriptase- und Protease-Gene des hochpolymorphen HIV-1-Genoms zu untersuchen, um genetische Vielfalt zu erkunden und Mutationen zu entdecken, die Resistenz gegen antivirale Medikamente verleihen. Ergebnisse dieser Anwendung legen nahe, dass Oligonukleotid-Sondenarrays ein leistungsfähiges Werkzeug für schnelle Untersuchungen bei Sequenzüberprüfung, Pathogenerkennung, Expressionsüberwachung und DNA-molekularer Erkennung sein werden.