Résumé LB331 : Intégration de multiples technologies transcriptomiques et protéomiques spatiales pour générer un atlas du cancer afin de comprendre le microenvironnement tumoral

Résumé La génomique unicellulaire approfondie a permis un bond monumental dans notre compréhension et analyse catégorique des cellules cancéreuses et de leurs propriétés moléculaires uniques. Grâce à des plateformes spatiales préservant l'architecture tissulaire, une compréhension émergente des interactions cellulaires complexes et des influences de l'environnement local fournit de nouvelles perspectives pour les thérapies ciblées. Ici, nous décrivons une approche complète pour profiler le microenvironnement immunitaire tumoral à travers plusieurs tumeurs solides afin de fournir un atlas de la biologie tumorale. Pour générer cet atlas, nous avons créé un panel MERFISH de 500 gènes représentant plus de 40 voies de phénotypage cellulaire et des dizaines de voies de signalisation incluant chimiokines, cytokines, interférons et interactions ligand-récepteur. Ce panel a été utilisé chez 15 patients représentant plusieurs malignités solides. Nous avons également utilisé le panel Xenium axé sur l'immuno-oncologie pour profiler 16 patients différents sur les mêmes indications. Avec les données Xenium, nous avons simultanément évalué l'expression protéomique en utilisant un panel 16-plex axé sur les cibles d'immuno-oncologie, suivi d'une Partie H 2 (Late-Breaking, Clinical Trial, and Invited Abstracts) ; 5-10 avr. 2024 ; San Diego, CA. Philadelphie (PA) : AACR; Cancer Res 2024 ; 84 (7Suppl) : Résumé nr LB331.