Résumé 4308 : Analyses multiomiques spatiales sur la même section utilisant la technologie MICS pour étudier la dynamique du microenvironnement tumoral

Résumé L'augmentation récente des technologies basées sur l'imagerie et à résolution spatiale permet aux chercheurs de profiler le microenvironnement tumoral (TME) en capturant les profils d'expression génique dans les sections de tissu. Cependant, une limitation importante de ces technologies est l'incapacité à résoudre simultanément les informations protéiques et ARN dans la même section, ainsi qu'à analyser commodément des ensembles de données multimodales. Ici, nous rapportons une méthode de détection spatiale de l'ARN, RNAsky, utilisant la plateforme MACSima™ de Miltenyi Biotec comme approche multiomique automatisée. Notre méthode intègre les données de protéomique et transcriptomique spatiales pour fournir un profilage approfondi avec une résolution cellule unique sur la même section de tissu. Nous démontrons ces capacités en caractérisant des marqueurs clés en immuno-oncologie à travers des tissus normaux et pathologiques en utilisant notre logiciel d'analyse spécialisé MACS® iQ View. MACS iQ View offre une segmentation rapide ainsi que des stratégies intuitives de gating et de regroupement pour évaluer simultanément les données protéiques et ARN. Nous avons étudié l’impact du regroupement utilisant la protéine, l’ARN, ou la combinaison des deux, afin d’évaluer la contribution des différentes modalités d’information sur la dynamique spatiale du TME. Cette approche de pointe permettra l’identification de paramètres précieux et de nouveaux types cellulaires, favorisant ainsi la découverte et le développement de biomarqueurs prédictifs et pronostiques. Format de citation : Dongju Park, Emily Neil, Rebecca C. Hennessey, Michael DiBuono, Hanna Lafayette, Erica Lloyd, Hsinyi Lo, Julia Femel, Alex Makrigiorgos, Shaina Lu, John Lee, Sameh Soliman, Dominic Mangiardi, Paurush Praveen, Fabian Staubach, Ryan Hindman, Thomas Rothmann, Telma Santos, Stefan Borbe, Hansueli Meyer, Tanya Wantenaar, Jinling Wang, Werner Müller, Robert Pinard, Andreas Bosio. Same-section spatial multiomic analyses using MICS technology for investigating the dynamics of the tumor microenvironment abstract. Dans : Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Partie 1 (Résumés réguliers) ; 5-10 avril 2024 ; San Diego, CA. Philadelphia (PA) : AACR ; Cancer Res 2024 ;84 (6Suppl) : Résumé n° 4308.