La carte de connectivité : utiliser les signatures d'expression génique pour connecter petites molécules, gènes et maladies

Pour adopter une approche systématique dans la découverte de connexions fonctionnelles entre maladies, perturbations génétiques et actions médicamenteuses, nous avons créé la première partie d'une collection de référence de profils d'expression génique issus de cellules humaines cultivées traitées avec des petites molécules bioactives, accompagnée d'un logiciel de reconnaissance de motifs pour exploiter ces données. Nous montrons que cette ressource « Connectivity Map » peut être utilisée pour trouver des liens entre petites molécules partageant un mécanisme d'action, entre produits chimiques et processus physiologiques, ainsi qu'entre maladies et médicaments. Ces résultats indiquent la faisabilité de cette approche et suggèrent la valeur d'un projet communautaire à grande échelle basé sur la Connectivity Map.