GEPIA : un serveur web pour le profilage de l'expression génique cancéreuse et normale et des analyses interactives

Une quantité énorme de données de séquençage ARN a été produite par de grands projets de consortium tels que TCGA et GTEx, créant de nouvelles opportunités pour l'exploration de données et une compréhension plus approfondie des fonctions géniques. Bien que certains serveurs web existants soient précieux et largement utilisés, de nombreuses fonctions d'analyse d'expression nécessaires aux biologistes expérimentaux ne sont toujours pas adéquatement prises en charge par ces outils. Nous présentons GEPIA (Gene Expression Profiling Interactive Analysis), un outil web offrant des fonctionnalités rapides et personnalisables basées sur les données TCGA et GTEx. GEPIA fournit des fonctions interactives et personnalisables clés incluant l'analyse différentielle d'expression, le tracé de profil, l'analyse de corrélation, l'analyse de survie des patients, la détection de gènes similaires et l'analyse de réduction de dimensionnalité. Les analyses complètes d'expression avec une navigation simple via GEPIA facilitent grandement l'exploration des données dans divers domaines de recherche, la discussion scientifique et le processus de découverte thérapeutique. GEPIA comble le fossé entre les mégadonnées génomiques du cancer et la fourniture d'informations intégrées aux utilisateurs finaux, aidant ainsi à libérer la valeur des ressources de données actuelles. GEPIA est accessible à http://gepia.cancer-pku.cn/.