Séquençage du génome humain utilisant des lectures de bases non enchaînées sur des nano-réseaux d'ADN auto-assemblés

Le séquençage du génome d'un grand nombre d'individus promet de faire progresser la compréhension, le traitement et la prévention des maladies humaines, entre autres applications. Nous décrivons une plateforme de séquençage du génome qui réalise une imagerie efficace et une faible consommation de réactifs grâce à une chimie de ligation combinatoire de sondes ancrées permettant d'analyser indépendamment chaque base à partir de nano-réseaux à motif de nanoboules d'ADN auto-assemblées. Nous avons séquencé trois génomes humains avec cette plateforme, générant en moyenne une couverture de 45 à 87 fois par génome et identifiant de 3,2 à 4,5 millions de variants de séquence par génome. La validation d'un jeu de données génomique démontre une précision de séquence d'environ 1 faux variant tous les 100 kilobases. La haute précision, le coût abordable de 4400 pour les consommables de séquençage et la scalabilité de cette plateforme permettent le séquençage complet du génome humain pour la détection de variants rares dans les études génétiques à grande échelle.