Ressources Bioinformatiques DAVID : base de données d'annotation étendue et nouveaux algorithmes pour mieux extraire la biologie de grandes listes de gènes

Tous les outils des Ressources Bioinformatiques DAVID visent à fournir une interprétation fonctionnelle de grandes listes de gènes issues d'études génomiques. Les Ressources Bioinformatiques DAVID récemment mises à jour comprennent la base de connaissances DAVID et cinq suites d'outils d'annotation fonctionnelle intégrées et accessibles via le web : l'Outil de Classification Fonctionnelle des Gènes DAVID, l'Outil d'Annotation Fonctionnelle DAVID, l'Outil de Conversion d'Identifiants de Gènes DAVID, le Visualiseur de Noms de Gènes DAVID et le Navigateur du Génome des Pathogènes NIAID DAVID. La base de connaissances DAVID étendue intègre désormais presque toutes les ressources bioinformatiques publiques majeures et bien connues, centralisées par le Concept de Gène DAVID, une méthode de liaison simple pour agglomérer des dizaines de millions d'identifiants de gènes/protéines divers et des termes d'annotation provenant de plusieurs bases de données bioinformatiques publiques. Pour toute liste de gènes téléchargée, les Ressources DAVID fournissent désormais non seulement l'analyse d'enrichissement typique gènes-termes, mais également de nouveaux outils et fonctions qui permettent aux utilisateurs de condenser de grandes listes de gènes en groupes fonctionnels, de convertir entre identifiants de gènes/protéines, de visualiser les relations nombreux-gènes-vers-nombreux-terms, de regrouper des termes redondants et hétérogènes en classes, de rechercher des gènes ou termes intéressants et connexes, de visualiser dynamiquement les gènes de leurs listes sur des bio-voies et plus encore. Avec DAVID (http://david.niaid.nih.gov), les chercheurs obtiennent plus de puissance pour interpréter les mécanismes biologiques associés à de grandes listes de gènes.