Analyse en grappes et affichage des modèles d'expression à l'échelle du génome

Un système d'analyse en grappes pour les données d'expression à l'échelle du génome issues de l'hybridation sur micropuces à ADN est décrit, utilisant des algorithmes statistiques standards pour organiser les gènes selon la similarité de leurs profils d'expression. La sortie est affichée graphiquement, véhiculant simultanément le regroupement et les données d'expression sous-jacentes dans une forme intuitive pour les biologistes. Nous avons constaté, chez la levure bourgeonnante Saccharomyces cerevisiae, que le regroupement des données d'expression génique rassemble efficacement les gènes de fonction connue similaire, et nous observons une tendance comparable dans les données humaines. Ainsi, les motifs observés dans les expériences d'expression à l'échelle du génome peuvent être interprétés comme des indications de l'état des processus cellulaires. De plus, la coexpression de gènes de fonction connue avec des gènes peu caractérisés ou nouveaux peut fournir un moyen simple d'orienter la recherche sur les fonctions de nombreux gènes pour lesquels l'information n'est pas encore disponible.