La transcriptomique unicellulaire révèle la dynamique du paysage immunitaire dans le cancer du sein métastatique positif aux récepteurs hormonaux traité par abémaciclib et thérapie endocrine

OBJECTIF : Dans le cancer du sein avancé positif au récepteur aux œstrogènes (ER+), négatif au récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain (HER2-), la combinaison des inhibiteurs des kinases dépendantes des cyclines 4 et 6 (CDK4/6i) avec une thérapie endocrine (ET) est la norme de traitement en première ligne. Bien que les CDK4/6i aient été initialement développés pour induire un arrêt du cycle cellulaire, il est évident que ces inhibiteurs peuvent également moduler le microenvironnement immunitaire tumoral. Ici, nous caractérisons le paysage immunitaire de base ainsi que les effets immunomodulateurs de l'abémaciclib et de la thérapie endocrine dans les tumeurs du cancer du sein avancé. MÉTHODES : Nous avons utilisé le séquençage ARN unicellulaire des cellules enrichies en CD45 afin d'étudier l'impact de l'abémaciclib et de la thérapie endocrine sur le transcriptome des populations cellulaires immunitaires dans 13 biopsies appariées de tumeurs mammaires avancées et métastatiques ER+/HER2-. Nous avons testé l'association entre les signatures géniques des populations cellulaires immunitaires et la survie dans des jeux de données publics. RÉSULTATS : Nous avons profilé 170 798 cellules provenant de biopsies osseuses, mammaires, ganglionnaires et hépatiques. Nous constatons que l'expression des gènes associés à la réponse à l'interféron est fortement diminuée dans de nombreuses populations de lymphocytes T. L'expression des gènes liés à la présentation d'antigènes est augmentée dans les macrophages associés à la tumeur (TAM) et les cellules dendritiques après traitement. La proportion relative de TAM TREM2+ diminue après traitement par abémaciclib et thérapie endocrine chez les patients à progression tardive, et une moindre expression de la signature TAM TREM2+ est associée à une meilleure survie globale chez les patients atteints de cancer du sein. CONCLUSIONS : Nos données révèlent des sous-populations lymphoïdes et myéloïdes hétérogènes dans les tumeurs du sein avancées et métastatiques qui sont associées à une progression tardive sous abémaciclib et thérapie endocrine ainsi qu’à la survie globale des patients atteints de cancer du sein.