आण्विक उपप्रकार द्वारा स्तन कैंसर माइक्रोएनवायरनमेंट संरचना का जीनोमिक विश्लेषण

सार स्तन कैंसर एक विषम रोग है जिसे नैदानिक रूप से तीन प्रमुख बायोमार्करों, अर्थात् ER, PR, और HER2 की अभिव्यक्ति द्वारा वर्गीकृत किया जाता है। नैदानिक उपप्रकारों के बीच, प्रतिरक्षा कोशिका प्रवेश का पूर्वानुमान मूल्य काफी भिन्न होता है। ट्रिपल-नेगेटिव/बेसल-जैसे ट्यूमर में, ट्यूमर में प्रवेश करने वाले लिम्फोसाइट्स (TILs) सकारात्मक पूर्वानुमान होते हैं, जबकि ER+/लुमिनल ट्यूमर में, TILs कम पूर्वानुमान होते हैं और कभी-कभी खराब परिणामों से जुड़े होते हैं। यह विपरीत, उपप्रकार-विशिष्ट व्यवहार प्रतिरक्षा प्रणाली की अलग भूमिकाओं का सुझाव देता है और इसे समझना महत्वपूर्ण है क्योंकि इम्यूनोमॉड्यूलेटरी उपचार स्तन कैंसर उपप्रकारों में बढ़कर परीक्षण और उपयोग किए जा रहे हैं। पूर्व के कार्य TCGA स्तन कैंसर बल्क RNA अनुक्रमण डेटा का उपयोग करते हुए पता चला कि अत्यधिक प्रतिरक्षा प्रवेश वाले ट्यूमर में, PAM50 आण्विक उपप्रकार के अनुसार प्रतिरक्षा माइक्रोएनवायरनमेंट में महत्वपूर्ण भिन्नता होती है। उच्च-TIL लुमिनल ट्यूमर में स्वाभाविक प्रतिरक्षा विशेषताओं की समृद्धि थी, जबकि उच्च-TIL HER2-समृद्ध और बेसल-जैसे ट्यूमर में क्रमशः B और T कोशिका विशेषताओं की उच्च अभिव्यक्ति थी। इन निष्कर्षों को आगे बढ़ाने के लिए, हमने 115 मानव स्तन ट्यूमर और 17 सामान्य ऊतक नमूनों से एकीकृत सिंगल-सेल RNA अनुक्रमण डेटासेट तैयार किया। सभी नैदानिक उपप्रकारों को कवर करने वाले नमूने चार सार्वजनिक रूप से उपलब्ध डेटासेटों से आए, और सेल प्रकार अंकन के लिए सामान्य जैव-सूचना तकनीकों का उपयोग किया गया। प्रत्येक नमूने में सेल प्रकार की आवृत्तियों की गणना की गई और PAM50 उपप्रकार द्वारा तुलना की गई। बेसल-जैसे ट्यूमर में कई प्रभावकारी T कोशिका और मैक्रोफेज़ आबादी की समृद्धि थी, जबकि HER2-समृद्ध में IgG-रिहा करने वाली प्लाज्मा कोशिकाओं की आवृत्ति अधिक थी। इसके विपरीत, लुमिनल A ट्यूमर में विभिन्न स्ट्रोमल सेल प्रकारों, जिनमें फाइब्रोब्लास्ट, एंडोथेलियल सेल और पेरीवास्कुलर-जैसे कोशिकाएं शामिल हैं, की समृद्धि थी; रोचक रूप से, एक मैक्रोफेज़ उपसमूह जो इम्यूनोप्रेसिव मार्कर TREM2 व्यक्त करता है, भी लुमिनल A में अधिक प्रचुर था। हमने अपने समूह से अत्यधिक प्रतिरक्षा प्रवेश वाले ट्यूमर की पहचान की और इन ट्यूमर में सेल प्रकार आवृत्तियों की PAM50 द्वारा तुलना की, यह पाया कि माइक्रोएनवायरनमेंट संरचना में उपप्रकार के अनुसार कई मूल अंतर प्रतिरक्षा-उच्च सेटिंग में भी बने रहते हैं। अंत में, हमने Bassez et al. (PMID: 33958794) के ट्यूमर के एक उपसमूह का विश्लेषण किया जिसमें T कोशिका विस्तार डेटा शामिल था, जो anti-PD1 इम्यूनोथेरेपी प्रतिक्रिया के लिए एक सूचक है। प्री-उपचार बेसल-जैसे ट्यूमर में, प्लाज्मा कोशिकाओं, प्रभावकारी T कोशिकाओं और नियामक T कोशिकाओं की बढ़ी हुई अनुपात anti-PD1 के बाद T कोशिका विस्तार से जुड़ी थी। चल रहे कार्य में लिगैंड-रेसेप्टर इंटरैक्शन भविष्यवाणी का उपयोग करके ट्यूमर-माइक्रोएनवायरनमेंट संवाद की जांच की जा रही है, जिसमें लुमिनल ट्यूमर में स्ट्रोमल कोशिकाओं और बेसल-जैसे में B कोशिका-T कोशिका संवाद पर जोर है; बाद वाले के लिए, प्रारंभिक विश्लेषण में CD40-CD40LG इंटरैक्शन एक संभावित क्लीनिकल हस्तक्षेप लक्ष्य के रूप में उभरा है ताकि रोगी परिणामों में सुधार किया जा सके और इसे वर्तमान में माउस मॉडल सिस्टम में परीक्षण किया जा रहा है। उद्धरण प्रारूप: Constandina (Dina) E. O'Connell, Alexander V. Lobanov, Kevin R. Mott, Daniel P. Hollern, Brian C. Miller, Charles M. Perou. Genomic analysis of microenvironment composition by breast cancer molecular subtype using an integrated single-cell RNA sequencing cohort abstract. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2026; Part 1 (Regular Abstracts); 2026 Apr 17-22; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 7427.