स्वचालित वर्चुअल-स्क्रीनिंग पाइपलाइनों में एक आवर्ती विफलता मोड होता है: सस्ते भविष्यवक्ता (Boltz-2 affinity, ADMET, xTB conformer scoring) हजारों उम्मीदवार स्कोर जमा करते हैं, लेकिन महंगे सत्यापन टियर (लंबे आणविक गतिशीलता, पूर्ण बाइंडिंग फ्री एनर्जी, वेट-लैब) असमान रूप से बढ़ते हैं क्योंकि शेड्यूलर प्रत्येक टियर की लागत, जानकारी मूल्य, गेट-नीति, और रनटाइम उपलब्धता के बारे में एक साथ विचार नहीं कर सकता। हम एक लागत-सचेत बहु-फिडेलिटी बायेसियन अनुकूलन (BO) शेड्यूलर का वर्णन करते हैं जो एक एकीकृत साक्ष्य लेज़र (789 कंपाउंड-टारगेट पंक्तियाँ, 136 स्तंभ) और बॉल्टज-2 कोफोल्ड (~मिनट/जोड़ी, GPU) से लेकर OpenFold3 + AQAffinity (~मिनट/जोड़ी, GPU) तक और वेट-लैब IC₅₀ / IVRT / IVPT (~₩100k+/नमूना, CRO) के बीच 7-टियर कास्केड पर कार्य करता है। अधिग्रहण स्कोर मिसिंग अक्षों पर अपेक्षित सुधार को टियर-विशिष्ट लागत प्रायर के साथ मिश्रित करता है; वैज्ञानिक गेट्स (scientificgates.yaml) और क्यूरेटर निर्देश सुरक्षा, नवीनता या प्रयोज्यता-डोमेन मानदंडों में विफल कंपाउंड्स के लिए प्रगति को अस्वीकार करते हैं। यह सुनिश्चित करने के लिए कि कोई टियर जिसके लिए रनटाइम उपलब्ध नहीं है, उस पर काम शेड्यूलर न डाले, हमने एक रनटाइम प्रोब जोड़ा जो प्रत्येक टियर के निष्पादन योग्य, मॉडल चेकपॉइंट, और निर्भरता को स्कोर करने से पहले हल करता है; रनटाइम अनुपलब्ध टियर को गेट-ब्लॉक्ड के बजाय रनटाइमब्लॉक्ड के रूप में चिह्नित किया जाता है, और लगातार समान हस्ताक्षर वाले अटके हुए वर्क-आइटम (3 या अधिक लगातार रन) को डाउनस्ट्रीम अवलोकनयोग्यता के लिए प्रति-रन क्यू-स्टेट JSON में रिकॉर्ड किया जाता है। हम वर्तमान डर्मेटोलॉजी वर्कलोड पर शेड्यूलर के व्यवहार की रिपोर्ट करते हैं: OpenFold3 प्रगति के लिए 752 कंपाउंड-टारगेट जोड़े कतारबद्ध, शीर्ष अधिग्रहण स्कोर 0.937, 8 प्रोटीन लक्ष्यों (TYR, DCT, MMP1, TYRP1, LOX, CTGF, TGFB1, PTGS2) में वितरित। रनटाइम-गेट भेद निर्णायक साबित हुआ: जब AQAffinity कैलिब्रेशन अधूरा था, तो 124 वर्क-आइटम को मmp1ᵦincₚending के तहत सही ढंग से रोका गया बजाय गलत रूप से बढ़ाने के। हम इस डिजाइन की चर्चा करते हैं जो इन सिलिको डर्मेटोलॉजी पाइपलाइनों के लिए पुन: प्रयोज्य आधार के रूप में कार्य करता है, सस्ते टियर संतृप्ति और महंगे टियर थ्रूपुट के बीच अंतराल, और टियर-विशिष्ट रनटाइम के विकास के समय लागत-प्रायर उत्सर्जन की सीमाओं। कीवर्ड: बहु-फिडेलिटी बायेसियन अनुकूलन, लागत-सचेत अधिग्रहण, स्वचालित खोज, साक्ष्य लेज़र, वैज्ञानिक गेट्स, रनटाइम गेटिंग, डर्मेटोलॉजी, OpenFold3, AQAffinity, Boltz-2 ---
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Cheongwoo Han
Genesis HealthCare
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Cheongwoo Han (Sun,) ने इस प्रश्न का अध्ययन किया।
www.synapsesocial.com/papers/69fa983604f884e66b531ec4 — DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.20018355
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