PubChem 2023年アップデート

PubChem（https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov）は、幅広い利用目的に対応する人気の化学情報リソースです。過去2年間で、PubChemには多数の変更が加えられました。120以上のデータソースからのデータがPubChemに追加されました。主なハイライトには、Google PatentsのデータをPubChemに統合し、PubChem特許データコレクションのカバレッジが大幅に拡大されたこと、細胞株および分類群のデータコレクションが作成され、それぞれ特定の細胞株および分類群に関する化学情報への迅速かつ簡便なアクセスが可能になったこと、生物アッセイのデータモデルの更新が含まれます。さらに、プログラム的アクセスプロトコルであるPUG-RESTおよびPUG-Viewに新機能が追加され、特定のタンパク質、遺伝子、経路、細胞株、分類群に対するターゲット中心のデータダウンロードがサポートされ、「standardize」オプションがPUG-RESTに追加され、入力化学構造の標準化形式が返されるようになりました。PubChemRDFにも大幅な更新が行われました。本稿ではこれらの変更点の概要を提供します。