分類学ノート：細菌学における現在の種の定義におけるDNA-DNA再結合および16S rRNA配列解析の位置づけ

自然な実体である「種」は系統樹上の近縁から遺伝的に明確に分離された菌株群として認識できないため、多面的アプローチ（L. G. Wayne, D. J. Brenner, R. R. Colwell, P. A. D. Grimont, O. Kandler, M. I. Krichevsky, L. H. Moore, W. E. C. Moore, R. G. E. Murray, E. Stackebrandt, M. P. Starr, および H. G. Trüper, Int. J. Syst. Bacteriol. 37:463-464, 1987）により種を定義し、その中でDNA再結合値約70%が支配的役割を果たす。16S rRNAの迅速な配列解析技術の確立と、それがあらゆる原核生物の系統的位置を決定する可能性の認識により、細菌学の現行種定義における16S rRNA類似性の役割を明確にする必要がある。比較研究は、この保存された遺伝子および遺伝子産物の配列解析が菌株レベルでの関係の同定に制限があることを明確に示しており、そのためDNA-DNA再結合実験が依然として優れた手法である。今日では16S rRNAの一次構造解析はDNA鎖間のハイブリダイゼーションよりも容易であるため、配列解析の強みはDNAペアリング研究が必要なレベル（特に97%以上の類似性）を認識することである。