deepTools：ディープシーケンシングデータを探索するための柔軟なプラットフォーム

我々は、深くシーケンスされたデータの処理と可視化のためのGalaxyベースのウェブサーバーを紹介します。このウェブサーバーのコア機能は、deepToolsと呼ばれる新たに開発されたツール群で構成されており、生物情報学の背景がほとんどないユーザーでもシーケンス実験の結果を標準化された設定で探索できるようにします。ユーザーは標準フォーマットの連続データを含む事前処理済みファイルをアップロードし、直感的かつ高度にカスタマイズ可能な方法でヒートマップや要約プロットを生成できます。加えて、整列リードを含むファイルの解析用ツールをいくつか提供し、正規化されたカバレッジファイルの効率的かつ再現性のある生成を可能にします。モジュール式かつオープンソースのプラットフォームとして、deepToolsは将来の要望や開発に応じて容易に拡張・カスタマイズすることができます。deepToolsウェブサーバーは無料で利用可能で、http://deeptools.ie-freiburg.mpg.de にて提供されており、ディープシーケンスデータ解析の原理を伝えるための詳細なドキュメントとチュートリアルが付随しています。ウェブサーバーは登録不要で利用可能です。deepToolsはスタンドアローンまたはGalaxyの一部としてローカルにインストール可能です。