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癌ゲノムの変化は治療への臨床応答に強く影響し、多くの場合、薬剤反応の強力なバイオマーカーとなります。Genomics of Drug Sensitivity in Cancer(GDSC)データベース(www.cancerRxgene.org)は、癌細胞の薬剤感受性および薬物反応の分子マーカーに関する最大の公開リソースです。データは無制限に自由に利用可能です。GDSCには現在、約700の癌細胞株に対する138種類の抗癌薬の反応を記述した約75,000の実験の薬剤感受性データが含まれています。薬物反応の分子マーカーを特定するために、細胞株の薬剤感受性データは、Catalogue of Somatic Mutations in Cancerデータベースから得られた大規模なゲノムデータセットと統合されており、癌遺伝子の体細胞変異、遺伝子増幅・欠失、組織タイプ、転写データなどの情報が含まれます。GDSCデータの解析は、特定の抗癌薬または癌遺伝子に関するクエリを基に薬剤感受性の分子バイオマーカーを特定することに焦点を当てたウェブポータルを通じて行われます。データのグラフィカルな表現が随所に使用され、関連リソースへのリンクがあり、すべてのデータセットは完全にダウンロード可能です。GDSCは大規模な薬剤感受性およびゲノムデータセットを統合した独自のリソースを提供し、癌治療のための新規治療バイオマーカーの発見を支援します。
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Wanjuan Yang
Jorge Soares
Patricia Greninger
Nucleic Acids Research
Howard Hughes Medical Institute
Massachusetts General Hospital
Wellcome Sanger Institute
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Yangら(木曜)はこの問題を研究しました。
www.synapsesocial.com/papers/69d78b01ef4aa71f97f3197c — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gks1111
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