悪性骨髄性疾患における染色体5の最小共通欠失領域を1～1.5 Mbに分子レベルで特定し、PACベースの物理マップを作成

染色体5全体の喪失または長腕の欠失（del(5q)）は、悪性骨髄性疾患における繰り返し観察される異常です。先行研究にて、バンド5q31内の約4 Mbの共通欠失セグメントを、近位側をIL9、遠位側をD5S166で挟まれた範囲として特定しました。本研究では、この領域のP1（PAC）、細菌（BAC）、酵母人工染色体（YAC）クローンの物理マップを作成しました。このコンティグは108クローン（78 PAC、2 BAC、28 YAC）からなり、125のマーカー（5遺伝子、11発現配列タグ、12多型、97配列タグ部位）にマッピングされています。del(5q)を有する白血病細胞に対する蛍光in situハイブリダイゼーション解析にPACクローンを用い、共通欠失セグメントをD5S479とD5S500の間で1～1.5 Mbに絞り込みました。対立遺伝子喪失を検索するため、共通欠失セグメント内外の7つのマイクロサテライトマーカーを用いて、5q喪失を持つ28例と、5q異常を細胞遺伝学的に検出できない14例の白血病細胞を検査しました。前者では細胞遺伝学的に観察される喪失と一致する半接合性欠失が検出され、ホモ接合性欠失は認められませんでした。後者では5番染色体異常がないため対立遺伝子喪失は検出されず、5qでの対立遺伝子喪失は可視染色体異常の結果であることが示唆されました。安定したPACコンティグの構築と最小共通欠失領域の同定により、5q上の骨髄白血病抑制遺伝子の分子クローン化が促進されます。