高密度オリゴヌクレオチド遺伝子発現マイクロアレイデータの特徴抽出および正規化アルゴリズム

高密度オリゴヌクレオチド遺伝子発現マイクロアレイ上で特徴抽出および正規化を行うアルゴリズムは十分に検討されておらず、これらのアルゴリズムが下流の解析に与える影響もよく理解されていません。遺伝子が存在するかどうか、ならびに差次的に発現しているかを検出する感度と特異性を高めるためには、このような低レベルの解析手法の進歩が不可欠です。私たちは、発現アレイデータ解析のためのいくつかのアルゴリズムをソフトウェアアプリケーションDNA-Chip Analyzer（dChip）にて開発・実装しました。本報告では、特徴抽出と正規化のためのアルゴリズムを説明し、検証データおよび現行で使用されているいくつかのアルゴリズムとの比較結果を提示します。