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NCBIにアーカイブされるデータセットの量と複雑さが急速に増加するにつれて、それに伴うメタデータを収集し整理する必要性も高まっています。これまでいくつかのアーカイブデータベース向けにメタデータは収集されていましたが、NCBIではこれらの情報を集約しデータベース間で統合して活用する中央集中的な方法はありませんでした。BioProjectデータベースは、NCBI、EBI、DDBJの各データベースに提出されるプロジェクトデータの組織化と分類を促進するために最近設立されました。これは大量の提出を伴う研究プロジェクトに関する記述的情報を取得し、複数のアーカイブ間の関連データを結び付け、利用者にデータの利用可能性を知らせる中央ポータルとして機能します。同時に、BioSampleデータベースはプロジェクトで調査される生物学的サンプルに関する記述情報を取得するために開発されています。BioProjectおよびBioSampleの記録は、アーカイブリポジトリに保存されている対応するデータへリンクしています。提出は、プロジェクトおよびサンプルに関する豊富なメタデータ入力を支援するウェブベースのSubmission Portalによってサポートされています。これらのデータベースにより、NCBIのアーカイブリポジトリに保管された膨大なデータを利用者が問合せ、検索、統合し解釈するための改善された手段が提供されます。BioProjectおよびBioSampleデータベースはそれぞれ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject および http://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample で利用可能です。
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Tanya Barrett
Karen Clark
R. Gevorgyan
Nucleic Acids Research
National Institutes of Health
National Center for Biotechnology Information
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Barrettら(木曜日)はこの問題を研究しました。
www.synapsesocial.com/papers/6a09ef1f16dfdfe7ed347b2b — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkr1163
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