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いくつかの高等真核生物のゲノム配列の完全な決定にもかかわらず、そのプロテオームは相対的に不明瞭なままです。異なる実験的および計算的手法によって特定されたタンパク質に関する情報は異なるデータベースに保存されており、単一のリソースでは既知および予測されるタンパク質の完全なカバーを提供していません。国際タンパク質インデックス(IPI)はこれらの問題に対処するために開発され、スイスプロテイン、TrEMBL、Ensembl、およびRefSeqデータベースから構築された、人間、マウスおよびラットのプロテオームを表す完全な非冗長データセットを提供します。
Kerseyら(Fri、)はこの問題を研究しました。