혈장 DNA의 저부하 전체 메틸롬 시퀀싱을 이용한 민감한 종양 검출, 정확한 정량화 및 암 아형 분류

초록 전이성 암 환자의 질병 모니터링을 위해 순환 종양 DNA(ctDNA) 분석이 점점 더 널리 사용되고 있습니다. 본 연구에서는 혈장 DNA의 저부하 전체 메틸롬 시퀀싱과 새로운 계산 도구인 METER를 결합한 강력하고 재현 가능한 전략을 소개합니다. 독립적인 공개 데이터셋으로 훈련된 예측 모델을 활용하여, METER는 종양 함량(TC)의 검출 및 정량화는 물론 분자 암 아형 분류를 수행합니다. 이 방법을 초기 전이성 유방암 환자의 혈장 메틸롬에 적용한 결과, 신뢰할 수 있는 정량화, TC 3% 미만에서의 민감한 종양 검출, 그리고 정확한 에스트로겐 수용체(ER) 아형 분류 능력을 입증하였습니다. METER는 관련 예후 인자들과의 연관성, 매칭된 순환 종양 세포와의 강건한 상관관계, 그리고 TC<3%와 같은 도전적인 상황에서 환자 결과와 높은 상관성을 통해 임상적으로 의미 있는 예측을 제공하였습니다. 본 전략은 혈장 샘플에 대한 포괄적이고 민감한 분석을 제공하여 가치 있고 비용 효율적인 정밀 종양학 도구로 활용될 수 있습니다.