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초록 배경 폐암(LC)은 전 세계적으로 사망률이 높은 암입니다. 조기 폐암에서 엑스트라크로모솜 DNA 분자(EcDNAm)의 분포 및 특성에 대한 연구는 드뭅니다. 방법 선형 DNA와 미토콘드리아 원형 DNA를 제거한 후, 두 쌍의 폐암 조직 샘플에서 EcDNAm을 추출하고 롤링 서클 증폭법으로 증폭하였습니다. 고처리량 엑스트라크로모솜 DNA 및 RNA 시퀀싱과 생물정보학 분석을 통해 EcDNAm의 분포와 본질을 탐구하였습니다. 크기가 큰 EcDNAm을 포함하는 종양유전자 역할을 더 잘 이해하기 위해 유전자 온톨로지(GO) 및 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) 경로 분석을 수행했습니다. 결과 RNA 시퀀싱 결과는 종양과 이에 상응하는 정상 샘플 간에 일부 유전자에서 유의미한 차이를 나타냈습니다. 동시에 재발한 종양 샘플과 비재발 종양 샘플 간에도 뚜렷한 차이가 관찰되었습니다. EcDNAm의 특성은 폐암 샘플과 일치하는 정상 샘플 간에 비교 가능했습니다. 일치하는 정상 샘플과 비교할 때, 드라이버 종양유전자를 포함하는 더 긴 크기의 EcDNAm(EcDNA) 수가 상대적으로 높았습니다. 본 연구에서 EcDNA의 대부분은 주로 종양 샘플에 집중되어 있었습니다. 암 샘플에 대한 풍부도 분석은 단백질 위치의 양성 조절, 축색 돌기 발달, 자궁 내 배아 발달과 같은 생물학적 과정에서의 풍부화를 보여주었습니다. 결론 본 연구는 조기 폐암에서 EcDNAm 분포의 보편성을 입증하고 그 본질을 기술했습니다. 또한 본 연구는 EcDNAm 연구의 공백을 메우며, 향후 연구는 조기 폐암 환자에서 잠재적 생체지표로서 EcDNA의 응용에 중점을 두어야 합니다.
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Jianfei Fang
Lisha Ying
Zhengxiao Ma
Chinese Academy of Sciences
Wenzhou Medical University
Zhejiang Cancer Hospital
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Fang 등(목요일)은 이 문제를 연구했습니다.
www.synapsesocial.com/papers/68e7556db6db6435876cd4ba — DOI: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-4010987/v1
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