ABCB4 유전자에서 유해한 단일 뉴클레오타이드 다형성에 대한 컴퓨터 조사 및 간 질환과의 잠재적 연관성

소개: 단일 뉴클레오타이드 다형성(SNP)은 질병 위험 및 기타 표현형에 영향을 미칠 수 있는 일반적인 유전적 변이 중 하나입니다. ABCB4는 간 기능에 중요한 인지질콜린 수송체를 암호화하며, ABCB4 돌연변이는 간 질환과 유방암과 연관될 수 있습니다. 목적: 이 연구는 실리코 방법론을 사용하여 ABCB4 유전자 내의 유해한 SNP를 식별하는 것을 목표로 합니다. 방법: ABCB4 아미노산 서열은 UniProt 데이터베이스에서 획득하였으며, 유전자 상호작용은 GeneMANIA를 사용하여 조사하였습니다. UCSC 유전체 브라우저에서 ABCB4 유전자의 135개의 SNP ID의 요약을 수집하였습니다. 유해한 SNP는 SIFT 및 PolyPhen으로 선별하였고, PROVEAN, SNAP, PhD-SNP 및 SNPs and GO로 검증하였습니다. 단백질 안정성에 미치는 영향은 I-Mutant, MuPRO 및 DynaMut를 사용하여 평가하였습니다. 결과: 135개의 SNP 중 4개의 비동의 SNP(C433W, K435E, R788P, R788Q)가 유해하다고 예측되었습니다. 우리는 이러한 변이가 단백질 안정성을 감소시키고 ABCB4의 활성에 심각한 영향을 미칠 수 있음을 보여주었습니다. 세 개의 SNP(rs8187801, rs20129202, rs201168284)가 임상적 관련성이 높은 확신의 후보로 확인되었습니다. 결론: 이 연구는 기능적 중요성이 있는 ABCB4 유전자 내의 간 질병 및 암 소인 nsSNP를 식별합니다. 이러한 연관성은 현재 위험 예측 및 유전자 상담을 제외하고는 직간접적으로 제한된 의학적 응용만 가능하지만, 표적 치료 전략의 식별에 주요 원동력이 될 것입니다.