SCANPY: 대규모 단일 세포 유전자 발현 데이터 분석

SCANPY는 단일 세포 유전자 발현 데이터 분석을 위한 확장 가능한 툴킷입니다. 전처리, 시각화, 군집화, 의사시간 및 궤적 추론, 차별 발현 검사, 유전자 조절 네트워크 시뮬레이션을 위한 방법들을 포함합니다. 파이썬 기반 구현으로 100만 개 이상의 세포 데이터셋도 효율적으로 처리합니다 ( https://github.com/theislab/Scanpy ). SCANPY와 함께 ANNDATA라는 주석 데이터 행렬을 다루는 일반 클래스도 제공합니다 ( https://github.com/theislab/anndata ).