흑색종 네오아쥬번트 면역관문 차단제 치료에서 공간적으로 분해된 면역 표지자

배경: 최근 흑색종에서의 혁신적인 네오아쥬번트 면역관문 차단제(NICB) 임상시험들은 의도적인 완치 수술 전 ICB 투여가 전이성 흑색종 및 그 외 영역에서 새로운 표준 치료가 될 것임을 결정적으로 보여주었다. 방사선영상 반응 평가에서 병리학적 반응 평가로의 패러다임 변화는 “치료 중” 조직을 풍부하게 획득하여 반응 메커니즘과 바이오마커를 밝히고 수술 후 개인 맞춤 치료 결정을 안내할 수 있는 전례 없는 “기회의 창”을 제공한다. 지금까지 단일세포/벌크 RNA 연구들은 TCF7+ 줄기형 CD8+ T 세포와 삼차 림프구조(TLS)가 ICB 반응의 긍정적 예측인임을 보여주었다. 그러나 이러한 면역세포들이 네오아쥬번트 종양 미세환경의 공간적 맥락 내에서 어떻게 조직되고 소통하는지는 아직 잘 알려지지 않았다. 방법: III기 전이성 흑색종 환자 87명으로부터 91개의 FFPE 생검 표본 코호트를 조사하였으며, 이 중 60명은 NICB 치료를 받았고(완전 반응 31, 부분 반응 7, 비반응 22), 27명은 치료 전 상태였다. 최첨단 기술인 다중오차내성 형광 현장혼성화법(MERFISH), FFPE 블록의 단일 세포 염기서열 분석 및 다중면역형광법을 활용하여 이 풍부한 디지털 자원을 구축하였다. 특히, 이러한 고차원 공간 데이터 분석을 위해 공간 수용체-리간드(R-L) 상호작용을 확장 가능하게 정량화하는 SCIRA, 단일세포 공간 데이터에서 배중심(GC)/TLS 구조를 탐지하는 그래프 기반 클러스터링 방법 GC-SCAN, 그리고 H 파트를 위한 자동 GC/TLS 탐지 AI 알고리즘 PathNet 등 3가지 신규 계산 알고리즘을 개발하였다. Part 1(일반 초록); 2026년 4월 17-22일; 샌디에이고, CA. 필라델피아(PA): AACR; Cancer Res 2026;86(7 Suppl):초록 번호 6564.