CEL-Seq: 다중화 선형 증폭에 의한 단일 세포 RNA-Seq

고처리량 시퀀싱은 유전자 발현 분석에 전례 없는 세부 정보를 제공하지만, 단일 세포에 효율적으로 적용하는 데는 RNA 시작량이 적어 어려움이 있습니다. 우리는 시료를 바코딩하고 풀링한 후 한 번의 in vitro 전사를 이용한 mRNA의 선형 증폭으로 이 한계를 극복하는 방법인 CEL-Seq를 개발했습니다. CEL-Seq가 PCR 기반 증폭법보다 더 재현성 높고, 선형적이며, 민감한 결과를 제공함을 보여줍니다. 이 방법의 강력함은 C. elegans 초기 배아 발달을 단일 세포 해상도로 연구함으로써 입증됩니다. 배아의 2세포 단계에서부터 자매 세포 간에 전사체 분포가 다르게 나타나며, 체세포 계통에서 수정자의 발현이 전사 인자에 풍부함을 확인했습니다. CEL-Seq가 가능하게 하는 견고한 전사체 정량화는 다양한 세포 유형의 집단을 포함하는 복잡한 조직의 전사체 분석에 유용할 것입니다.