CODEX 다중이미징을 이용한 마우스 비장 구조의 심층 프로파일링

co-detection by indexing (CODEX)이라 불리는 고도의 다중 세포 계량 이미징 기법을 이용하여 정상 및 루푸스(MRL/lpr) 생쥐 비장의 다중 데이터셋을 생성하였다. CODEX는 DNA 바코드, 형광 dNTP 유사체, 현장 중합 기반 인덱싱 절차를 사용하여 항체 결합 이벤트를 반복적으로 시각화한다. 촘촘히 배열된 조직에서 단일 세포 항원 정량화를 위한 알고리즘 파이프라인이 개발되었고, 이를 통해 잘 알려진 형태학적 특징과 새로운 림프 조직 구조를 단일 세포 및 세포 이웃 수준에서 겹쳐보았다. 우리는 세포 이웃이 면역 세포의 단백질 수용체 발현에 미치는 예상치 못한 심대한 영향을 관찰하였다. 정상 생쥐 비장과 전신 자가면역 질환(MRL/lpr) 모델의 비장을 비교함으로써 건강 상태와 질병 상태에서의 광범위하고 이전에 특성화되지 않은 비장 세포 상호작용 역학을 확인하였다. 여기서 입증된 다중 공간 세포측정의 충실도는 정상 및 임상적 이상 샘플에서 조직 구조를 정량적으로 전신 특성화할 수 있음을 보여준다.