Slide-seq: 높은 공간 해상도로 전장 유전체 발현을 측정하기 위한 확장 가능한 기술

조직 내 세포의 공간 위치는 기능에 강력한 영향을 미치지만, 세포 해상도로 유전자 발현을 전장 유전체 수준에서 대량으로 읽어내는 방법은 부족합니다. 우리는 알려진 위치를 가진 DNA 바코드 비드로 덮인 표면에 조직 절편에서 RNA를 전달하는 방법인 Slide-seq을 개발하여, 시퀀싱을 통해 RNA의 위치를 추론할 수 있게 했습니다. Slide-seq을 사용하여, 우리는 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터셋으로 식별된 세포 유형들을 소뇌와 해마 내에서 위치화하고, 마우스 소뇌의 Purkinje 층에서 공간 유전자 발현 패턴을 특성화했으며, 외상성 뇌 손상 마우스 모델에서 세포 유형별 반응의 시간적 진화를 정의했습니다. 이 연구들은 Slide-seq이 개별 세포 크기와 유사한 해상도로 공간적으로 구분된 유전자 발현 데이터를 획득할 수 있는 확장 가능한 방법을 제공함을 강조합니다.