미토콘드리아 포트레이트: 중간 네트워크를 이용한 인간 집단 분석.

미토콘드리아 DNA (mtDNA)의 하이퍼변이 영역에서의 변이 분석은 인간의 진화와 이동을 연구하는 중요한 도구로 부상했습니다. 그러나 최적의 내종 mtDNA 계통수를 재구성하려는 시도는 병렬 돌연변이 사건이 실제 진화 경로를 부분적으로 가리기 때문에 자주 실패합니다. 이것은 동등하게 허용 가능한 계통수를 무시하고 단일 계통수만 제시하는 것이 바람직하지 않음을 의미합니다. 대안으로, 우리는 mtDNA 관계를 나타내기 위한 새로운 네트워크 접근법을 제안합니다. 작은 샘플 크기 (< 약 50)에 대해 수정되지 않은 중간 네트워크는 모든 가장 간단한 나무를 포함하며, 서열 데이터의 전체 정보 내용을 그래픽으로 표시하고 손으로 쉽게 생성할 수 있습니다. 더 큰 샘플 크기에 대해서는 병렬성을 식별하여 네트워크의 복잡성을 줄입니다. 이 축소 절차는 호환성 논리와 미토콘드리아 하플로타입의 빈도라는 추가적인 계통 정보 출처에 의해 안내됩니다. 우리의 접근법은 그 결과로 불가능한 네트워크 하위 구조에서 나타나는 시퀀싱 오류를 식별하는 데도 도움을 줄 수 있습니다. 우리는 기존 데이터 세트의 여러 예를 통해 우리의 접근법의 장점을 설명합니다.