摘要 使用双重消化限制位点关联DNA测序(ddRADseq)调查了日本亚洲黑熊(Ursus thibetanus)的遗传结构和种群历史。对83个个体的分析揭示了七个具有明显地理结构的区域种群。贝叶斯聚类和主坐标分析显示中央种群的遗传分化较低,而边缘种群的分化较高。根据SNP数据推测的有效种群数量(Ne)波动显示,最初的下降发生在大约20万年前,随后在大多数种群中经历了两次额外的减少,并没有恢复的迹象。这些下降可能与来自大陆的迁移、末次冰盛期的栖息地丧失以及人类扩张有关。核数据表明,跨线粒体DNA谱系边界存在男性偏向的基因流动。孤立种群表现出低杂合度和高遗传分化,强调了栖息地碎片化的影响。这是对亚洲黑熊进行的大规模种群基因组研究,为保护和未来的基因组研究提供了重要见解。
Ohnishi等(周四)研究了这个问题。