Sphingomonas 속의 구성원들은 그들의 대사적 다재다능성과 식물과의 밀접한 관계로 인해 어디에나 존재하는 표면 거주자로 알려져 있습니다. 여기서 우리는 마녀의 빗자루 저항성 컵과수(테오브로마 그란디플로룸) 유전형 C174의 잎에서 회수된 Sphingomonas의 8개의 고급 메타게놈 조립 유전체(MAGs)를 설명하고 비교합니다. 이 MAGs는 4개의 알려진 종(S. adhaesiva (bin09, bin18, bin28), S. fennica (bin11), S. phyllospherae (bin08, bin10), S. taxi (bin15, bin20))와 CandidatusSphingomonascupuassunensis로 제안된 하나의 새로운 계통을 대표합니다. 15개의 참조 Sphingomonas 유전체와의 비교 분석을 통해 623개의 보존된 상동성 단백질 군(core)을 발견하였고, 이는 이 속 내에서의 광범위한 적응적 플라스틱성을 반영합니다. 기능적 주석 작성은 외인성 분해, 질소 대사, 분비 시스템 및 탄수화물 활성 효소에서 상당한 변동성을 발견했습니다. 특히, avrXca를 포함한 효과자 관련 단백질을 암호화하는 유전자가 S. phyllospherae (bin08, bin10) 및 S. adhaesiva (bin09, bin28)에서 확인되어, 숙주 식물과의 잠재적인 면역 조절 상호작용을 제안합니다. 이러한 발견은 컵과수 표면에 서식하는 Sphingomonas의 유전체 및 기능적 다양성을 강조하며, 열대 식물-미생물 공생 및 숙주 질병 저항성에서의 역할을 탐구하기 위한 진화적 및 생태적 틀을 제공합니다. Sphingomonas 속에 속하는 MAGs의 다양성 및 잠재력을 분석하기 위해 사용된 단계 및 방법론 요약
Silva et al. (Thu,)는 이 질문을 연구했습니다.