L'association génomique des métabolites glucidiques apporte de nouvelles perspectives à l'amélioration fonctionnelle du café

Le café est l'une des boissons les plus consommées dans le monde, principalement issu de Coffea arabica, reconnu pour sa saveur supérieure, et de Coffea canephora (Robusta/Conilon), apprécié pour sa résistance et sa teneur plus élevée en caféine. La sélection fonctionnelle vise à développer des cultivars combinant productivité, tolérance au stress, avec des qualités améliorées liées à la santé et au goût. Étant donné que les polymères glucidiques représentent plus de 50 % du poids sec du grain de café vert et servent de précurseurs clés des composés aromatiques et bioactifs, nous avons émis l'hypothèse que l'élucidation de l'architecture génétique des métabolites glucidiques offrirait de nouvelles opportunités pour la sélection moléculaire du café. Pour tester cette hypothèse, nous avons intégré le profilage des glucides de la paroi cellulaire avec des analyses génomiques dans une collection génétiquement diversifiée de café englobant Coffea canephora et Coffea arabica. Des études d'association génomique à grande échelle ont identifié 14 loci génomiques majeurs associés à la variation de la composition des polysaccharides de la paroi cellulaire. En utilisant la qualité de la tasse comme critère fonctionnel final, nous avons en outre relié les profils glucidiques aux évaluations sensorielles et proposons un cadre pour mettre en œuvre la sélection assistée par marqueurs afin d'accélérer l'amélioration du goût dans les programmes de sélection du café.