本研究对在相同条件下收集的太平洋鲍鱼(Haliotis discus hannai)十种主要组织进行了定量蛋白质组学比较。共识别出4184种蛋白质,经过标准化和批量校正后,1904种蛋白质被定量分析。利用基于串联质谱标签的液相色谱-质谱技术,进行了差异表达分析、多变量统计分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA),系统表征了组织特异性的蛋白质表达谱。肝胰腺表现出高丰度的代谢和解毒蛋白,而血淋巴则显示出减少的与翻译相关的蛋白质,但免疫和神经相关的蛋白质则显著增加。卵巢富含与溶菌酶家族蛋白相关的卵黄包膜受体,而鳃则主要由纤毛结构成分如微管和结构蛋白主导。WGCNA揭示了与组织显著相关的共同表达模块(|r| ≥ 0.5, p < 0.05),验证了差异表达结果。观察到的蛋白质分布与每个组织已知的生理角色相符,支持了数据集的内部一致性。本研究提供了在匹配分析条件下生成的跨组织定量蛋白质组学参考,可能作为假设生成和随后的鲍鱼验证研究的基础资源。• 太平洋鲍鱼(Haliotis discus hannai)十种组织的定量蛋白质组学比较。• 总共检测到4184种蛋白质,数据处理后1904种被定量。• 与生理功能相对应的独特蛋白质组模式。• DEA、PLS-DA和WGCNA等多种方法显示出大体一致的模式。• 本研究为生理学研究提供了定量蛋白质组学资源。
Mok等(周四)研究了这个问题。