Résumé Le complexe de prothrombinase, composé du facteur (f) Xa et de fVa, convertit la prothrombine en thrombine par clivage séquentiel à deux sites de manière rapide et processive. La base moléculaire du traitement de la prothrombine est un mystère enzymatique dont la résolution nécessite une compréhension structurelle de la façon dont le substrat et l'intermédiaire se lient à la prothrombinase. Ici, nous présentons deux structures de prothrombinase à 3,1 Å obtenues par cryo-EM, liées à la prothrombine et à la méizothrombine. Le complexe de prothrombine a révélé une interaction surprenante entre l'extrémité de la chaîne lourde de fVa et l'exosite I de la prothrombine, représentant 70 % de l'interface de contact. Le déclenchement du changement conformational zymogène-en protéase suivant le clivage à Arg320 modifie toutes les interactions entre domaines et fVa observées pour la prothrombine, et entraîne un réarrangement à grande échelle de la méizothrombine qui présente le deuxième site de clivage (Arg271) pour le traitement. Ensemble, ces structures révèlent un mécanisme enzymatique remarquable qui nécessite la participation active du substrat lui-même, et introduisent un nouveau paradigme d'« allostérie du substrat ».
Üstok et al. (Wed,) ont étudié cette question.